羅氏 NimbleGen 比較基因組雜交(CGH )芯片可助鑒別精神類基因組疾病的特征
高分辨率的比較基因組雜交技術(CGH)已迅速成為分子細胞遺傳學檢測所選擇的一種方法,并被用來鑒別與精神發(fā)育遲滯、癌癥和其它復雜表型相關的染色體異常的特征。在《醫(yī)學遺傳學雜志》最近公布的兩項研究中,高分辨率的NimbleGen CGH芯片被用來進一步鑒別近期識別出的兩種基因組疾病的特征。
在第一項研究中,van Bon和同僚們采用定制的NimbleGen CGH 12x135K 和 4x72K 芯片,準確地描繪出了一系列伴有發(fā)育遲緩和正常核型的人體內(nèi)的15q13區(qū)域的染色體斷裂位點。對15q13.3 微缺失綜合癥的初步鑒定顯示,在類似于Prader Willi綜合癥、Angelman綜合癥和Williams-Beuren綜合癥(3)的弱智患者中經(jīng)常出現(xiàn)這一癥狀。在目前對其他18人進行的隱匿性15q13.3 缺失研究分析顯示,其中至少有11人出現(xiàn)差異較大的家族內(nèi)和家族間疾病特征,且伴有遺傳性缺失。除此之外,在來自四個家族的10位兄弟姐妹中,有7人也帶有隱匿性缺失,其疾病特征表現(xiàn)為輕度發(fā)育遲緩、幼兒學習障礙和無可識別表型的不同癥狀。在對同一區(qū)域出現(xiàn)重復綜合癥的4人的分析中,無法找到共同的可識別表型,盡管發(fā)現(xiàn)其中2人的精神不正常。有趣的是,在近期對16名精神分裂癥患者進行的一項研究中發(fā)現(xiàn)15q13區(qū)域的染色體缺失,其中1人還患有孤獨癥。 以上所有這些研究的數(shù)據(jù)都將 15q13.3微缺失綜合癥與各種疾病特征聯(lián)系在一起,包括正常發(fā)育至輕度和重度的精神發(fā)育遲滯和精神疾病,并對"遺傳自明顯正常的父母的染色體異常通常沒有臨床意義"的慣常說法發(fā)起了挑戰(zhàn)。
與染色體17q21.31有關的第二種新型基因組疾病最近被識別出來,截止目前,在醫(yī)學文獻中公布的17q21.31缺失共有14例。在初步報告中,定制的NimbleGen CGH芯片被用來界定一個最小的臨界 478 kb缺失區(qū)域。在當前的研究中,Koolen和同僚們采用一個定制的 NimbleGen 385K 芯片,準確地描繪出了其他5位受感染患者中的染色體斷裂位點。該分析的結(jié)果把17q21.31臨界區(qū)域縮小至一個含有至少6個基因的424 kb區(qū)域,其中包括與多種神經(jīng)變性疾病有關的MAPT 基因。此外,NimbleGen CGH芯片在雙親樣本中識別出了與致病性缺失有關的特異性多態(tài)。
以上所有這些研究的數(shù)據(jù)都把17q21.31微缺失綜合癥確認為在臨床上和分子上均可識別的基因組疾病,在患有無法解釋的精神發(fā)育遲滯、且大部分尚未診斷出的人群中的發(fā)病頻率為0.64%。
上述這些研究說明了,NimbleGen CGH芯片憑借獨具特色的高分辨率與高靈活性的設計,使新型微缺失綜合癥的識別和分子特性研究成為可能的,它還使人們認識到了此類綜合癥能代表無法預知且差異很大的疾病特征。持續(xù)對微缺失和重復綜合癥的識別與特征描述進行研究對建立起臨床診斷標準是至關重要的。
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