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安捷倫靶向序列富集系統(tǒng)測序成本降低高達(dá)16倍
2010年2月24,安捷倫科技公司宣布:安捷倫SureSelect 靶向序列富集系統(tǒng),可以根據(jù)用戶所選擇的不同新一代測序平臺,實現(xiàn)每泳道12-16個樣本的并行DNA測序,從而降低測序成本并提升測序高達(dá)16倍。
"我們最初設(shè)計安捷倫SureSelect靶向序列富集系統(tǒng)的目的,就是通過只對感興趣基因組區(qū)域測序幫助遺傳學(xué)家高效地分析更大量的樣本,"安捷倫新興基因組學(xué)應(yīng)用市場經(jīng)理Fred Ernani博士說,"安捷倫SureSelect系統(tǒng)最新支持的多樣本并行技術(shù)進(jìn)一步擴(kuò)大了這一優(yōu)勢,在不犧牲數(shù)據(jù)質(zhì)量的前提下,顯著減少了成本并提高了通量。"
這一方法非常實用并易于開展,能夠?qū)崿F(xiàn)一次實驗分析多個樣本,但對所得數(shù)據(jù)又可以進(jìn)行獨立分析。這一試劑盒針對Illumina 基因組分析儀和Applied Biosystems SOLiD平臺分別進(jìn)行了優(yōu)化。Illumina系統(tǒng)每泳道可測序12個樣本,所以一次運(yùn)行共可測序96個樣本。SOLiD平臺每四分之一或八分之一玻片能測序16個樣本,因而最多一次運(yùn)行能測序256個樣本。
首批具有多樣本并行技術(shù)的安捷倫SureSelect產(chǎn)品是使用eArray--安捷倫微陣列和SureSelect產(chǎn)品在線設(shè)計工具--完成的定制試劑盒。此試劑盒以多種不同的規(guī)格進(jìn)行包裝,每個定制試劑盒可分別進(jìn)行10-5000個反應(yīng)。不同規(guī)格的試劑盒,使研究者能夠采用同一技術(shù)進(jìn)行小規(guī)模的初步研究以及后續(xù)的大規(guī)模篩選,而且這些試劑盒都具有相同的產(chǎn)品格式并易于自動化。預(yù)計,支持多樣本并行技術(shù)的預(yù)制試劑盒將會于今年晚些時候上市。
"一些客戶正在測試這一安捷倫SureSelect新產(chǎn)品,他們對測試結(jié)果非常滿意" Ernani如是說。
安捷倫SureSelect靶向序列富集系統(tǒng),采用哈佛-麻省理工的Broad研究所授權(quán)的技術(shù)方法,目前已成為適用多種不同的測序應(yīng)用和平臺的最佳選擇。它支持Illumina系統(tǒng)的單末端測序和雙末端測序方案,以及SOLiD系統(tǒng)的片段文庫測序方案。用戶使用安捷倫eArray在線設(shè)計工具,可以輕松設(shè)計出在單個試管中捕獲任意感興趣基因組的定制產(chǎn)品,從而有效提高研究效率。
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